Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJC1P36383 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJC1P36383 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJC1P36383 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJC1P36383 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJC1P36383 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJC1P36383 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GJC1P36383 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJC1P36383 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJC1P36383 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms