Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT2P35908 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT2P35908 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT2P35908 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT2P35908 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT2P35908 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT2P35908 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT2P35908 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT2P35908 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT2P35908 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms