Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF4P34130 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF4P34130 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF4P34130 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF4P34130 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF4P34130 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF4P34130 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF4P34130 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTF4P34130 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms