Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA3P32297 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA3P32297 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms