Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms