Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms