Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRIP30626 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRIP30626 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRIP30626 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRIP30626 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRIP30626 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRIP30626 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRIP30626 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRIP30626 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRIP30626 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRIP30626 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRIP30626 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRIP30626 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms