Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms