Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPOP30536 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSPOP30536 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSPOP30536 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPOP30536 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms