Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
COL4A5P29400 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
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