Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID4AP29374 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID4AP29374 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms