Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTGFP29279 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTGFP29279 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTGFP29279 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTGFP29279 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTGFP29279 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTGFP29279 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTGFP29279 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTGFP29279 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTGFP29279 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTGFP29279 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTGFP29279 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTGFP29279 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTGFP29279 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTGFP29279 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTGFP29279 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTGFP29279 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTGFP29279 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTGFP29279 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTGFP29279 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTGFP29279 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTGFP29279 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTGFP29279 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CTGFP29279 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTGFP29279 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTGFP29279 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTGFP29279 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms