Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms