Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAP3P28838 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAP3P28838 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAP3P28838 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAP3P28838 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAP3P28838 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAP3P28838 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAP3P28838 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAP3P28838 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAP3P28838 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAP3P28838 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAP3P28838 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAP3P28838 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAP3P28838 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAP3P28838 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAP3P28838 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAP3P28838 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms