Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRMP28827 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
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