Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms