Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms