Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms