Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA6P23229 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms