Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms