Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTF3P20783 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTF3P20783 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF3P20783 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF3P20783 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF3P20783 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTF3P20783 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms