Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms