Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DPA1P20036 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DPA1P20036 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms