Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCLP19338 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLP19338 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLP19338 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCLP19338 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCLP19338 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCLP19338 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCLP19338 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLP19338 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCLP19338 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCLP19338 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms