Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB4P17483 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms