Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF3P15923 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF3P15923 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms