Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFAP15692 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms