Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL5P13501 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL5P13501 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL5P13501 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL5P13501 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCL5P13501 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCL5P13501 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCL5P13501 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCL5P13501 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCL5P13501 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL5P13501 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL5P13501 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL5P13501 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL5P13501 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL5P13501 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL5P13501 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL5P13501 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL5P13501 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL5P13501 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL5P13501 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL5P13501 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL5P13501 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL5P13501 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL5P13501 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL5P13501 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL5P13501 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL5P13501 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms