Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF1P10914 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF1P10914 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF1P10914 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF1P10914 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF1P10914 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF1P10914 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF1P10914 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF1P10914 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF1P10914 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms