Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTXN2P0C2S0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms