Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIL1P09327 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIL1P09327 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIL1P09327 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIL1P09327 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms