Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms