Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms