Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSD2O96028 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSD2O96028 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSD2O96028 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSD2O96028 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSD2O96028 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSD2O96028 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSD2O96028 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSD2O96028 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSD2O96028 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSD2O96028 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms