Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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