Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNTO95613 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNTO95613 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNTO95613 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNTO95613 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNTO95613 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNTO95613 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNTO95613 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNTO95613 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNTO95613 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNTO95613 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNTO95613 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNTO95613 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNTO95613 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNTO95613 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNTO95613 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNTO95613 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNTO95613 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNTO95613 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNTO95613 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNTO95613 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNTO95613 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNTO95613 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms