Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms