Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVILO95425 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVILO95425 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SVILO95425 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SVILO95425 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SVILO95425 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SVILO95425 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SVILO95425 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SVILO95425 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVILO95425 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVILO95425 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVILO95425 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms