Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT3O95395 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT3O95395 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms