Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM13AO94988 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms