Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms