Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 WASHC3-209ENST00000540536 883 ntTSL 39.75□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 UMAD1-203ENST00000471760 470 ntTSL 59.66□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SLC8B1-208ENST00000549372 555 ntTSL 59.53□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 MED30-204ENST00000522839 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LIMCH1-215ENST00000512632 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 P3H1-206ENST00000447502 453 ntTSL 39.41□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZFR-205ENST00000507465 1140 ntTSL 59.4□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 POU2F1-207ENST00000442313 496 ntTSL 39.11□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LIMCH1-209ENST00000509277 3474 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 AKT2-238ENST00000581582 655 ntTSL 38.93□□□□□ -0.987e-11■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RALGAPA2-204ENST00000430436 8769 ntTSL 58.86□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 AC007848.1-201ENST00000538430 1405 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -11e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMEM108-203ENST00000508711 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.011e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 NXF1-215ENST00000533440 579 ntTSL 28.7□□□□□ -1.021e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RNF213-205ENST00000558116 3768 ntTSL 28.45□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 MIR193BHG-204ENST00000634265 892 ntTSL 58.23□□□□□ -1.091e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CCDC77-212ENST00000543504 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 WASHC3-207ENST00000538761 886 ntTSL 37.99□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PHKB-209ENST00000566275 1375 ntTSL 37.82□□□□□ -1.161e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZNF521-206ENST00000577775 552 ntTSL 37.5□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZNF521-202ENST00000399425 4345 ntTSL 1 (best)7.49□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LIMCH1-207ENST00000508466 3051 ntTSL 27.49□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CYTH1-211ENST00000589768 988 ntTSL 37.28□□□□□ -1.241e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.251e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZSCAN5A-208ENST00000588442 576 ntTSL 47.19□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZSCAN5A-211ENST00000590675 570 ntTSL 27.16□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CCDC77-206ENST00000537286 706 ntTSL 36.97□□□□□ -1.291e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 IREB2-202ENST00000558525 865 ntTSL 56.84□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TH2LCRR-201ENST00000417516 390 ntTSL 26.81□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PHKB-215ENST00000568171 1113 ntTSL 36.77□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 IREB2-205ENST00000559215 572 ntTSL 46.6□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.371e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KIF23-208ENST00000559283 1081 ntTSL 56.47□□□□□ -1.371e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GNS-209ENST00000545273 906 ntTSL 56.32□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SPICE1-206ENST00000496105 3521 ntTSL 26.06□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.451e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 IREB2-203ENST00000558570 2917 ntTSL 1 (best)5.96□□□□□ -1.461e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 WASHC3-208ENST00000539515 688 ntTSL 35.67□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.511e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SUSD1-208ENST00000528773 540 ntTSL 45.55□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.551e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.561e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMEM108-206ENST00000511555 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 35.22□□□□□ -1.571e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TMEM108-204ENST00000510183 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 35.22□□□□□ -1.571e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GNS-206ENST00000541781 1846 ntTSL 55.04□□□□□ -1.61e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZSCAN5A-204ENST00000587075 641 ntTSL 34.97□□□□□ -1.611e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.621e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.621e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GNS-204ENST00000540196 907 ntTSL 54.55□□□□□ -1.681e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ARHGAP42-205ENST00000529406 449 ntTSL 34.43□□□□□ -1.71e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 C4orf45-203ENST00000508011 756 ntTSL 34.43□□□□□ -1.71e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 COPB2-210ENST00000512309 565 ntTSL 54.28□□□□□ -1.724e-16■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PARN-213ENST00000564904 468 ntTSL 53.9□□□□□ -1.791e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.851e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KIF23-209ENST00000559456 1282 ntTSL 33.5□□□□□ -1.851e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KCNMB2-AS1-201ENST00000421498 393 ntTSL 32.48□□□□□ -2.011e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ARHGAP42-202ENST00000524649 489 ntTSL 32.29□□□□□ -2.041e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ARHGAP42-208ENST00000534060 501 ntTSL 31.93□□□□□ -2.11e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 WASHC3-210ENST00000541569 569 ntTSL 21.63□□□□□ -2.151e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TSPAN17-205ENST00000504168 884 ntTSL 526.17■■□□□ 1.784e-7■■■■■ 160.1
SF3B1O75533 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.614e-7■■■■■ 160.1
SF3B1O75533 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.14e-7■■■■■ 160.1
SF3B1O75533 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 160.1
SF3B1O75533 TSPAN17-203ENST00000503030 909 ntTSL 318.24■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 160.1
SF3B1O75533 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 160.1
SF3B1O75533 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 160.1
SF3B1O75533 TSPAN17-206ENST00000507471 707 ntTSL 315.37■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 160.1
SF3B1O75533 TSPAN17-208ENST00000514705 4445 ntTSL 214.1□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 160.1
SF3B1O75533 UCKL1-205ENST00000483710 524 ntTSL 310.95□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 160
SF3B1O75533 CORO7-209ENST00000571756 1890 ntTSL 217.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 160
SF3B1O75533 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 159.9
SF3B1O75533 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 159.9
SF3B1O75533 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.318e-7■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.268e-7■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 214.93□□□□□ -0.028e-7■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 214.59□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.238e-7■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 FAM19A2-216ENST00000552075 570 ntTSL 412.47□□□□□ -0.419e-8■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 FAM19A2-209ENST00000549456 839 ntTSL 55.56□□□□□ -1.529e-8■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.559e-8■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 FAM19A2-208ENST00000549379 3252 ntTSL 1 (best)5.02□□□□□ -1.619e-8■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 FAM19A2-204ENST00000547919 555 ntTSL 51.06□□□□□ -2.249e-8■■■■■ 159.7
SF3B1O75533 DOK4-209ENST00000566705 751 ntTSL 518.48■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 159.4
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1285.3 ms