Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms