Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP9O43818 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP9O43818 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP9O43818 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP9O43818 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP9O43818 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP9O43818 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP9O43818 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP9O43818 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP9O43818 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP9O43818 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP9O43818 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP9O43818 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP9O43818 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP9O43818 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP9O43818 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRP9O43818 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP9O43818 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRP9O43818 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP9O43818 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP9O43818 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP9O43818 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP9O43818 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRP9O43818 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RRP9O43818 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms