Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms