Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L1O43166 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1L1O43166 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms