Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM2O43147 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM2O43147 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms