Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VGFO15240 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VGFO15240 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VGFO15240 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VGFO15240 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VGFO15240 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
VGFO15240 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
VGFO15240 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
VGFO15240 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VGFO15240 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VGFO15240 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VGFO15240 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VGFO15240 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VGFO15240 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VGFO15240 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VGFO15240 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VGFO15240 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VGFO15240 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VGFO15240 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VGFO15240 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VGFO15240 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VGFO15240 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VGFO15240 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VGFO15240 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
VGFO15240 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VGFO15240 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VGFO15240 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VGFO15240 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms