Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms