Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PES1O00541 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PES1O00541 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PES1O00541 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PES1O00541 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PES1O00541 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PES1O00541 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PES1O00541 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PES1O00541 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PES1O00541 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PES1O00541 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PES1O00541 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PES1O00541 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PES1O00541 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PES1O00541 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PES1O00541 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PES1O00541 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PES1O00541 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PES1O00541 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms